3. LigaFußball(M)
16. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | VfL Osnabrück | Osnabrück | 16 | 11 | 2 | 3 | 25:11 | 14 | 35 |
| 2 |  | Preußen Münster | Pr. Münster | 16 | 9 | 5 | 2 | 29:14 | 15 | 32 |
| 3 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 16 | 9 | 4 | 3 | 29:20 | 9 | 31 |
| 4 |  | Arminia Bielefeld | Bielefeld | 16 | 9 | 4 | 3 | 24:16 | 8 | 31 |
| 5 |  | Hansa Rostock | Rostock | 16 | 8 | 4 | 4 | 20:18 | 2 | 28 |
| 6 |  | Karlsruher SC | Karlsruhe | 16 | 6 | 7 | 3 | 20:11 | 9 | 25 |
| 7 |  | 1. FC Heidenheim 1846 | Heidenheim | 16 | 7 | 4 | 5 | 27:24 | 3 | 25 |
| 8 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 16 | 8 | 1 | 7 | 22:21 | 1 | 25 |
| 9 |  | Chemnitzer FC | Chemnitz | 16 | 6 | 4 | 6 | 20:18 | 2 | 22 |
| 10 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 16 | 6 | 5 | 5 | 26:19 | 7 | 21 |
| 11 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 16 | 6 | 3 | 7 | 21:20 | 1 | 21 |
| 12 |  | 1. FC Saarbrücken | Saarbrücken | 16 | 6 | 2 | 8 | 20:26 | -6 | 20 |
| 13 |  | SV Wehen Wiesbaden | Wiesbaden | 16 | 2 | 11 | 3 | 19:19 | 0 | 17 |
| 14 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 16 | 4 | 4 | 8 | 18:18 | 0 | 16 |
| 15 |  | SV Babelsberg 03 | Babelsberg | 16 | 4 | 4 | 8 | 13:22 | -9 | 16 |
| 16 |  | Hallescher FC | Hallescher FC | 16 | 3 | 6 | 7 | 13:22 | -9 | 15 |
| 17 |  | SV Darmstadt 98 | Darmstadt | 16 | 3 | 5 | 8 | 15:24 | -9 | 14 |
| 18 |  | Alemannia Aachen | Aachen | 16 | 3 | 7 | 6 | 17:23 | -6 | 11 |
| 19 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 16 | 2 | 5 | 9 | 16:31 | -15 | 11 |
| 20 |  | Borussia Dortmund II | Dortmund II | 16 | 2 | 5 | 9 | 13:30 | -17 | 11 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Abstieg
- Kickers Offenbach wurde vom DFB die Lizenz für die Drittligasaison 2013/2014 verweigert. Dem SV Darmstadt 98 blieb infolgedessen der Abstieg in die Regionalliga erspart.
- Nach Beendigung der Saison werden Alemannia Aachen und Kickers Offenbach aufgrund von Verstößen im Rahmen des wirtschaftlichen Zulassungsverfahrens jeweils 2 Punkte abgezogen.
- Alemannia Aachen wurde zudem aufgrund der nicht fristgerechten Rückzahlung von 200.000 Euro aus dem DFB-Kautionsfond mit einem Abzug von weiteren drei Punkten bestraft.
