3. LigaFußball(M)
35. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | Karlsruher SC | Karlsruhe | 35 | 21 | 9 | 5 | 63:24 | 39 | 72 |
| 2 |  | Arminia Bielefeld | Bielefeld | 35 | 20 | 10 | 5 | 57:31 | 26 | 70 |
| 3 |  | Preußen Münster | Pr. Münster | 35 | 19 | 12 | 4 | 59:28 | 31 | 69 |
| 4 |  | VfL Osnabrück | Osnabrück | 35 | 20 | 7 | 8 | 59:34 | 25 | 67 |
| 5 |  | 1. FC Heidenheim 1846 | Heidenheim | 35 | 20 | 7 | 8 | 65:44 | 21 | 67 |
| 6 |  | Chemnitzer FC | Chemnitz | 35 | 14 | 9 | 12 | 49:44 | 5 | 51 |
| 7 |  | SV Wehen Wiesbaden | Wiesbaden | 35 | 10 | 18 | 7 | 46:45 | 1 | 48 |
| 8 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 35 | 13 | 9 | 13 | 44:47 | -3 | 48 |
| 9 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 35 | 12 | 9 | 14 | 40:44 | -4 | 45 |
| 10 |  | 1. FC Saarbrücken | Saarbrücken | 35 | 12 | 9 | 14 | 49:55 | -6 | 45 |
| 11 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 35 | 11 | 10 | 14 | 33:36 | -3 | 43 |
| 12 |  | Hansa Rostock | Rostock | 35 | 11 | 8 | 16 | 36:49 | -13 | 41 |
| 13 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 35 | 10 | 10 | 15 | 40:53 | -13 | 40 |
| 14 |  | Hallescher FC | Hallescher FC | 35 | 10 | 9 | 16 | 32:47 | -15 | 39 |
| 15 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 35 | 10 | 9 | 16 | 38:42 | -4 | 37 |
| 16 |  | Borussia Dortmund II | Dortmund II | 35 | 8 | 12 | 15 | 34:54 | -20 | 36 |
| 17 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 35 | 9 | 8 | 18 | 36:46 | -10 | 35 |
| 18 |  | SV Darmstadt 98 | Darmstadt | 35 | 7 | 13 | 15 | 27:42 | -15 | 34 |
| 19 |  | SV Babelsberg 03 | Babelsberg | 35 | 8 | 10 | 17 | 28:45 | -17 | 34 |
| 20 |  | Alemannia Aachen | Aachen | 35 | 6 | 10 | 19 | 36:61 | -25 | 23 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Abstieg
- Kickers Offenbach wurde vom DFB die Lizenz für die Drittligasaison 2013/2014 verweigert. Dem SV Darmstadt 98 blieb infolgedessen der Abstieg in die Regionalliga erspart.
- Nach Beendigung der Saison werden Alemannia Aachen und Kickers Offenbach aufgrund von Verstößen im Rahmen des wirtschaftlichen Zulassungsverfahrens jeweils 2 Punkte abgezogen.
- Alemannia Aachen wurde zudem aufgrund der nicht fristgerechten Rückzahlung von 200.000 Euro aus dem DFB-Kautionsfond mit einem Abzug von weiteren drei Punkten bestraft.
