3. LigaFußball(M)
32. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | Karlsruher SC | Karlsruhe | 32 | 19 | 9 | 4 | 56:20 | 36 | 66 |
| 2 |  | Arminia Bielefeld | Bielefeld | 32 | 18 | 10 | 4 | 52:26 | 26 | 64 |
| 3 |  | Preußen Münster | Pr. Münster | 32 | 17 | 11 | 4 | 55:26 | 29 | 62 |
| 4 |  | VfL Osnabrück | Osnabrück | 32 | 18 | 6 | 8 | 53:31 | 22 | 60 |
| 5 |  | 1. FC Heidenheim 1846 | Heidenheim | 32 | 18 | 6 | 8 | 58:41 | 17 | 60 |
| 6 |  | Chemnitzer FC | Chemnitz | 32 | 13 | 9 | 10 | 46:38 | 8 | 48 |
| 7 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 32 | 13 | 8 | 11 | 42:42 | 0 | 47 |
| 8 |  | SV Wehen Wiesbaden | Wiesbaden | 32 | 8 | 18 | 6 | 40:39 | 1 | 42 |
| 9 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 32 | 11 | 8 | 13 | 36:39 | -3 | 41 |
| 10 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 32 | 10 | 9 | 13 | 30:34 | -4 | 39 |
| 11 |  | Hallescher FC | Hallescher FC | 32 | 10 | 9 | 13 | 30:40 | -10 | 39 |
| 12 |  | 1. FC Saarbrücken | Saarbrücken | 32 | 10 | 8 | 14 | 44:53 | -9 | 38 |
| 13 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 32 | 10 | 9 | 13 | 38:37 | 1 | 37 |
| 14 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 32 | 9 | 8 | 15 | 37:51 | -14 | 35 |
| 15 |  | Hansa Rostock | Rostock | 32 | 9 | 7 | 16 | 29:45 | -16 | 34 |
| 16 |  | SV Babelsberg 03 | Babelsberg | 32 | 8 | 9 | 15 | 25:40 | -15 | 33 |
| 17 |  | Borussia Dortmund II | Dortmund II | 32 | 7 | 12 | 13 | 32:50 | -18 | 33 |
| 18 |  | SV Darmstadt 98 | Darmstadt | 32 | 6 | 13 | 13 | 24:39 | -15 | 31 |
| 19 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 32 | 7 | 7 | 18 | 29:43 | -14 | 28 |
| 20 |  | Alemannia Aachen | Aachen | 32 | 6 | 10 | 16 | 30:52 | -22 | 23 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Abstieg
- Kickers Offenbach wurde vom DFB die Lizenz für die Drittligasaison 2013/2014 verweigert. Dem SV Darmstadt 98 blieb infolgedessen der Abstieg in die Regionalliga erspart.
- Nach Beendigung der Saison werden Alemannia Aachen und Kickers Offenbach aufgrund von Verstößen im Rahmen des wirtschaftlichen Zulassungsverfahrens jeweils 2 Punkte abgezogen.
- Alemannia Aachen wurde zudem aufgrund der nicht fristgerechten Rückzahlung von 200.000 Euro aus dem DFB-Kautionsfond mit einem Abzug von weiteren drei Punkten bestraft.
