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3. LigaFußball(M)
31. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | Karlsruher SC | Karlsruhe | 31 | 19 | 9 | 3 | 55:18 | 37 | 66 |
| 2 |  | Preußen Münster | Pr. Münster | 31 | 17 | 10 | 4 | 52:23 | 29 | 61 |
| 3 |  | Arminia Bielefeld | Bielefeld | 31 | 17 | 10 | 4 | 50:26 | 24 | 61 |
| 4 |  | VfL Osnabrück | Osnabrück | 31 | 18 | 6 | 7 | 51:28 | 23 | 60 |
| 5 |  | 1. FC Heidenheim 1846 | Heidenheim | 31 | 17 | 6 | 8 | 57:41 | 16 | 57 |
| 6 |  | Chemnitzer FC | Chemnitz | 31 | 12 | 9 | 10 | 45:38 | 7 | 45 |
| 7 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 31 | 12 | 8 | 11 | 40:41 | -1 | 44 |
| 8 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 31 | 11 | 7 | 13 | 36:39 | -3 | 40 |
| 9 |  | SV Wehen Wiesbaden | Wiesbaden | 31 | 7 | 18 | 6 | 37:37 | 0 | 39 |
| 10 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 31 | 10 | 9 | 12 | 30:33 | -3 | 39 |
| 11 |  | Hallescher FC | Hallescher FC | 31 | 10 | 8 | 13 | 30:40 | -10 | 38 |
| 12 |  | 1. FC Saarbrücken | Saarbrücken | 31 | 10 | 7 | 14 | 41:50 | -9 | 37 |
| 13 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 31 | 10 | 8 | 13 | 38:37 | 1 | 36 |
| 14 |  | Hansa Rostock | Rostock | 31 | 9 | 7 | 15 | 29:43 | -14 | 34 |
| 15 |  | Borussia Dortmund II | Dortmund II | 31 | 7 | 12 | 12 | 32:49 | -17 | 33 |
| 16 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 31 | 8 | 8 | 15 | 36:51 | -15 | 32 |
| 17 |  | SV Babelsberg 03 | Babelsberg | 31 | 8 | 8 | 15 | 25:40 | -15 | 32 |
| 18 |  | SV Darmstadt 98 | Darmstadt | 31 | 6 | 12 | 13 | 24:39 | -15 | 30 |
| 19 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 31 | 7 | 7 | 17 | 29:42 | -13 | 28 |
| 20 |  | Alemannia Aachen | Aachen | 31 | 6 | 9 | 16 | 30:52 | -22 | 22 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Abstieg
- Kickers Offenbach wurde vom DFB die Lizenz für die Drittligasaison 2013/2014 verweigert. Dem SV Darmstadt 98 blieb infolgedessen der Abstieg in die Regionalliga erspart.
- Nach Beendigung der Saison werden Alemannia Aachen und Kickers Offenbach aufgrund von Verstößen im Rahmen des wirtschaftlichen Zulassungsverfahrens jeweils 2 Punkte abgezogen.
- Alemannia Aachen wurde zudem aufgrund der nicht fristgerechten Rückzahlung von 200.000 Euro aus dem DFB-Kautionsfond mit einem Abzug von weiteren drei Punkten bestraft.
