3. LigaFußball(M)
32. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 32 | 20 | 10 | 2 | 53:18 | 35 | 70 |
| 2 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 32 | 17 | 7 | 8 | 54:31 | 23 | 58 |
| 3 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 32 | 17 | 6 | 9 | 48:39 | 9 | 57 |
| 4 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 32 | 16 | 7 | 9 | 44:27 | 17 | 55 |
| 5 |  | Bayern München II | Bayern II | 32 | 12 | 14 | 6 | 41:30 | 11 | 50 |
| 6 |  | Kickers Emden | Emden | 32 | 13 | 9 | 10 | 38:36 | 2 | 48 |
| 7 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 32 | 12 | 11 | 9 | 37:29 | 8 | 47 |
| 8 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 32 | 13 | 7 | 12 | 40:39 | 1 | 46 |
| 9 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 32 | 11 | 10 | 11 | 48:44 | 4 | 43 |
| 10 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 32 | 11 | 10 | 11 | 39:35 | 4 | 43 |
| 11 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 32 | 11 | 9 | 12 | 50:41 | 9 | 42 |
| 12 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 32 | 11 | 9 | 12 | 38:39 | -1 | 42 |
| 13 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 32 | 11 | 7 | 14 | 35:36 | -1 | 40 |
| 14 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 32 | 9 | 9 | 14 | 31:40 | -9 | 36 |
| 15 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 32 | 8 | 11 | 13 | 29:44 | -15 | 35 |
| 16 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 32 | 7 | 14 | 11 | 28:48 | -20 | 35 |
| 17 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 32 | 8 | 9 | 15 | 32:50 | -18 | 33 |
| 18 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 32 | 8 | 8 | 16 | 33:52 | -19 | 32 |
| 19 |  | Werder Bremen II | Werder II | 32 | 7 | 9 | 16 | 39:51 | -12 | 30 |
| 20 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 32 | 5 | 10 | 17 | 32:60 | -28 | 25 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
