3. LigaFußball(M)
30. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 30 | 18 | 10 | 2 | 47:17 | 30 | 64 |
| 2 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 30 | 16 | 7 | 7 | 52:29 | 23 | 55 |
| 3 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 30 | 15 | 7 | 8 | 42:26 | 16 | 52 |
| 4 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 30 | 15 | 6 | 9 | 44:38 | 6 | 51 |
| 5 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 30 | 12 | 11 | 7 | 37:26 | 11 | 47 |
| 6 |  | Kickers Emden | Emden | 30 | 13 | 8 | 9 | 38:33 | 5 | 47 |
| 7 |  | Bayern München II | Bayern II | 30 | 10 | 14 | 6 | 37:28 | 9 | 44 |
| 8 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 30 | 12 | 7 | 11 | 38:36 | 2 | 43 |
| 9 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 30 | 11 | 9 | 10 | 46:41 | 5 | 42 |
| 10 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 30 | 11 | 8 | 11 | 48:37 | 11 | 41 |
| 11 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 30 | 10 | 10 | 10 | 36:33 | 3 | 40 |
| 12 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 30 | 9 | 9 | 12 | 34:37 | -3 | 36 |
| 13 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 30 | 10 | 6 | 14 | 32:35 | -3 | 36 |
| 14 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 30 | 8 | 10 | 12 | 28:42 | -14 | 34 |
| 15 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 30 | 8 | 9 | 13 | 30:39 | -9 | 33 |
| 16 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 30 | 6 | 14 | 10 | 25:44 | -19 | 32 |
| 17 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 30 | 7 | 9 | 14 | 28:47 | -19 | 30 |
| 18 |  | Werder Bremen II | Werder II | 30 | 7 | 8 | 15 | 37:48 | -11 | 29 |
| 19 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 30 | 7 | 8 | 15 | 30:50 | -20 | 29 |
| 20 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 30 | 5 | 10 | 15 | 31:54 | -23 | 25 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
