3. LigaFußball(M)
16. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 16 | 11 | 2 | 3 | 33:17 | 16 | 35 |
| 2 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 16 | 10 | 2 | 4 | 27:12 | 15 | 32 |
| 3 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 16 | 9 | 5 | 2 | 28:14 | 14 | 32 |
| 4 |  | Kickers Emden | Emden | 16 | 9 | 4 | 3 | 22:14 | 8 | 31 |
| 5 |  | Bayern München II | Bayern II | 16 | 6 | 9 | 1 | 23:17 | 6 | 27 |
| 6 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 16 | 7 | 5 | 4 | 22:20 | 2 | 26 |
| 7 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 16 | 8 | 1 | 7 | 24:19 | 5 | 25 |
| 8 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 16 | 6 | 6 | 4 | 22:17 | 5 | 24 |
| 9 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 16 | 6 | 5 | 5 | 31:22 | 9 | 23 |
| 10 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 16 | 6 | 5 | 5 | 28:24 | 4 | 23 |
| 11 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 16 | 5 | 5 | 6 | 22:23 | -1 | 20 |
| 12 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 16 | 4 | 6 | 6 | 21:27 | -6 | 18 |
| 13 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 16 | 3 | 9 | 4 | 11:19 | -8 | 18 |
| 14 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 16 | 4 | 5 | 7 | 18:20 | -2 | 17 |
| 15 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 16 | 4 | 5 | 7 | 18:25 | -7 | 17 |
| 16 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 16 | 4 | 4 | 8 | 12:19 | -7 | 16 |
| 17 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 16 | 4 | 3 | 9 | 22:35 | -13 | 15 |
| 18 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 16 | 2 | 6 | 8 | 15:30 | -15 | 12 |
| 19 |  | Werder Bremen II | Werder II | 16 | 2 | 4 | 10 | 19:29 | -10 | 10 |
| 20 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 16 | 1 | 7 | 8 | 20:35 | -15 | 10 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
