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3. LigaFußball(M)
38. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 38 | 22 | 12 | 4 | 59:23 | 36 | 78 |
| 2 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 38 | 20 | 9 | 9 | 54:33 | 21 | 69 |
| 3 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 38 | 20 | 8 | 10 | 68:38 | 30 | 68 |
| 4 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 38 | 20 | 7 | 11 | 57:46 | 11 | 67 |
| 5 |  | Bayern München II | Bayern II | 38 | 14 | 17 | 7 | 54:38 | 16 | 59 |
| 6 |  | Kickers Emden | Emden | 38 | 16 | 11 | 11 | 45:44 | 1 | 59 |
| 7 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 38 | 12 | 16 | 10 | 40:35 | 5 | 52 |
| 8 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 38 | 12 | 14 | 12 | 58:52 | 6 | 50 |
| 9 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 38 | 13 | 11 | 14 | 46:46 | 0 | 50 |
| 10 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 38 | 13 | 11 | 14 | 46:48 | -2 | 50 |
| 11 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 38 | 13 | 10 | 15 | 61:50 | 11 | 49 |
| 12 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 38 | 12 | 12 | 14 | 43:43 | 0 | 48 |
| 13 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 38 | 12 | 9 | 17 | 46:51 | -5 | 45 |
| 14 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 38 | 11 | 12 | 15 | 36:45 | -9 | 45 |
| 15 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 38 | 11 | 12 | 15 | 37:51 | -14 | 45 |
| 16 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 38 | 10 | 11 | 17 | 41:59 | -18 | 41 |
| 17 |  | Werder Bremen II | Werder II | 38 | 10 | 10 | 18 | 49:58 | -9 | 40 |
| 18 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 38 | 10 | 10 | 18 | 40:65 | -25 | 40 |
| 19 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 38 | 8 | 15 | 15 | 38:60 | -22 | 39 |
| 20 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 38 | 7 | 11 | 20 | 38:71 | -33 | 32 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
